More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0572 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 758 aa  1544    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 739 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 766 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 730 aa  267  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 704 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 741 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 710 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 758 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 758 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 769 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 783 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 743 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 780 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 764 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 722 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 720 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 723 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 734 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 730 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 771 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 803 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 785 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 726 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 776 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 713 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 722 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 809 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 731 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 738 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.41 
 
 		 733 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 784 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 726 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 730 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 792 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 795 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 747 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 780 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 729 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 785 aa  185  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 744 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 779 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 773 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 873 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 789 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 763 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 797 aa  180  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 754 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 764 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 759 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 771 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 756 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 743 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.69 
 
 		 741 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 737 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 755 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 761 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 802 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 695 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 717 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 796 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.62 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 773 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 777 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 792 aa  170  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 825 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 735 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 758 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 790 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 767 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 782 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 751 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 794 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 741 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 778 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 779 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 783 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 786 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 775 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 777 aa  164  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 851 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 703 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 743 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 783 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 757 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 725 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 790 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 		 767 aa  161  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 784 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 763 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 783 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 773 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 757 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 767 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>