More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0779 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 757 aa  1550    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 738 aa  363  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 744 aa  350  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 766 aa  347  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 759 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 758 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 807 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.31 
 
 		 739 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 		 747 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 749 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 755 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 733 aa  218  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 737 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 730 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 812 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 726 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 794 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 763 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 761 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 704 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 753 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 771 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 723 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 725 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 775 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 722 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 780 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 720 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 731 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 734 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 748 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 779 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 829 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 722 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 767 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 786 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 713 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 782 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 822 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 785 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 758 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 753 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 732 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  24.43 
 
 		 797 aa  171  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 785 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 753 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 757 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 758 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 724 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 758 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 807 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 777 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 758 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 732 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 802 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 743 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 700 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 780 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.39 
 
 		 741 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 758 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 797 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 765 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 728 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 784 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 774 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 728 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 776 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 717 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 757 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 796 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 733 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 806 aa  152  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 690 aa  150  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 776 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 771 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 690 aa  150  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 786 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 771 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 750 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 794 aa  146  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 779 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 784 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 767 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 806 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 774 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 		 733 aa  144  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>