More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2522 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  100 
 
 
700 aa  1412    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  45.57 
 
 
713 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  42.65 
 
 
695 aa  500  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 
702 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 
732 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 
767 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 
733 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 
737 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
713 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 
818 aa  289  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 
685 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 
779 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
718 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 
759 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 
703 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 
710 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 
730 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 
720 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 
726 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
704 aa  250  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 
724 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 
790 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 
763 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 
853 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 
751 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
743 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 
851 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 
771 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.92 
 
 
715 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
747 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 
802 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 
758 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
730 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 
746 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 
722 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
777 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 
734 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 
783 aa  223  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
775 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 
757 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 
765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 
794 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 
717 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 
732 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
774 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
755 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.83 
 
 
739 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
763 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
761 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 
761 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
758 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
766 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
720 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 
764 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 
756 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
737 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
764 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
743 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.89 
 
 
759 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 
723 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
736 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
712 aa  203  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 
792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
743 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 
817 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 
755 aa  200  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 
741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 
773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  26.75 
 
 
789 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 
726 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
771 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
785 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
808 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
731 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
726 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
722 aa  193  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
903 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 
822 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
725 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
795 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
690 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
687 aa  190  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
764 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 
745 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 
753 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 
791 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 
767 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
773 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 
758 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
729 aa  188  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
809 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
771 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
789 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
690 aa  185  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 
733 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
773 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
780 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
784 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
732 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>