More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1671 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 732 aa  1467    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 		 724 aa  456  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 751 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 732 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 720 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 704 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 803 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  30.22 
 
 		 715 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 710 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 774 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 787 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 784 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.21 
 
 		 739 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 775 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 763 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 766 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 741 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 728 aa  214  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 734 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 746 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 783 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  28.81 
 
 		 822 aa  212  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 777 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 		 754 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 722 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 790 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 792 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 755 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 797 aa  207  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 790 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 695 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 779 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 761 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 713 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 730 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 780 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 753 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 687 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.75 
 
 		 755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 690 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 730 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 753 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 764 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.12 
 
 		 784 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 703 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 741 aa  197  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 733 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 778 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 690 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 764 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 795 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 725 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 753 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 767 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 720 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 717 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 771 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 700 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 804 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 773 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 771 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 763 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 771 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 761 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 809 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 773 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 785 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 738 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 790 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 786 aa  184  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 730 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 733 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 767 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 730 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 797 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 802 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 790 aa  180  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 723 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 767 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 832 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 794 aa  178  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 794 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 803 aa  177  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 722 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 856 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 765 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 726 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.29 
 
 		 759 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 786 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>