More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0504 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 777 aa  1573    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  36.38 
 
 		 780 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 769 aa  289  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 704 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 761 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 723 aa  267  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 720 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 710 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 741 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 722 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 730 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 763 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 803 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 783 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 864 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 919 aa  243  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 765 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 751 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 729 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 796 aa  240  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 757 aa  236  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 786 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 724 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 780 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 767 aa  235  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 		 839 aa  234  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 822 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 803 aa  231  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 732 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 809 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 840 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 788 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 726 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 775 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 		 739 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 753 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 790 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 761 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 764 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 862 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 792 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 790 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 749 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 778 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 790 aa  224  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.27 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 838 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 731 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 771 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 775 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 790 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 825 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 735 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 808 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 783 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 700 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 759 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 789 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 743 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 783 aa  217  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 824 aa  216  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 800 aa  216  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 800 aa  216  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 730 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 758 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 722 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 780 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 766 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 778 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 771 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 786 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 764 aa  214  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 745 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 814 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 808 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 695 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  26.92 
 
 		 807 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 796 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 784 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 780 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 797 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 753 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 750 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 903 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 855 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 848 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 797 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 702 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 851 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 717 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 767 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 773 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 794 aa  208  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 815 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 730 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 862 aa  207  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 799 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>