More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0812 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1570    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  37.75 
 
 		 803 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 807 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 755 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 792 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 790 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 859 aa  402  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 780 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 761 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  33.99 
 
 		 790 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 851 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 832 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 860 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 867 aa  369  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 765 aa  361  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 776 aa  325  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 743 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 761 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  31.56 
 
 		 739 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 704 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 720 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 783 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 745 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 728 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 710 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 730 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 728 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 741 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 856 aa  275  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 749 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 784 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 796 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 775 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 786 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.5 
 
 		 755 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 734 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 763 aa  262  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 787 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 750 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 761 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 759 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 730 aa  256  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 775 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 771 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 758 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 764 aa  251  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 771 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 732 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 758 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 758 aa  247  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 758 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 767 aa  243  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 774 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 741 aa  242  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 792 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 794 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 729 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 771 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 770 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 756 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 803 aa  240  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 817 aa  240  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 780 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.11 
 
 		 754 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 759 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 726 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 730 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 809 aa  237  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 779 aa  236  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 722 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 753 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 743 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 777 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 784 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.39 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 773 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 755 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 751 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 862 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 717 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 797 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 722 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 763 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 808 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 724 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 880 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 853 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 795 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 766 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  29.28 
 
 		 807 aa  218  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 731 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 782 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 758 aa  217  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 778 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 755 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 767 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>