More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2240 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 695 aa  1405    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  42.94 
 
 		 713 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  41.87 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  38.26 
 
 		 702 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  36.65 
 
 		 767 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 733 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 732 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 713 aa  340  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 685 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 703 aa  317  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 718 aa  316  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 737 aa  300  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 704 aa  297  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 710 aa  296  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  29.96 
 
 		 715 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 720 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 724 aa  270  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 818 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 761 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 763 aa  264  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 759 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 761 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 853 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 783 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 851 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 747 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 720 aa  251  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 844 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 730 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 726 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 784 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 775 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 769 aa  245  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 782 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 722 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 794 aa  239  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 751 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 774 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 761 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 792 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 756 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 712 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 771 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 722 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 731 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.21 
 
 		 748 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 766 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 		 754 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 734 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 764 aa  224  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 777 aa  223  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 780 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 732 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 790 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 764 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 736 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 730 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 695 aa  219  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 690 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 743 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 763 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 690 aa  218  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 739 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 761 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 743 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 797 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 687 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 758 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 717 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 755 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 755 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 737 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 790 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 764 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 744 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 738 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 773 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 771 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 771 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 733 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 802 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 773 aa  205  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.18 
 
 		 759 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 749 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 767 aa  203  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 757 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 732 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 789 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 735 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 748 aa  200  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>