More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1672 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  98.12 
 
 
851 aa  1688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  100 
 
 
853 aa  1722    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  32.8 
 
 
715 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 
720 aa  295  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  30 
 
 
687 aa  271  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
713 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 
695 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 
712 aa  251  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
690 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
690 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
697 aa  240  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 
729 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 
748 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
757 aa  237  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
743 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 
700 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
732 aa  235  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
743 aa  234  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
713 aa  234  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
736 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
763 aa  233  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 
702 aa  232  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
666 aa  230  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 
744 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 
744 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 
733 aa  227  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 
761 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 
794 aa  224  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 
763 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
695 aa  219  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 
747 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 
744 aa  217  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
729 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 
767 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
733 aa  211  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
730 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
730 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 
739 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 
710 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
764 aa  200  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
730 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
775 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 
864 aa  198  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
694 aa  199  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
762 aa  199  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 
803 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
783 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
802 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
753 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 
803 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
765 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
713 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 
704 aa  195  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
724 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 
761 aa  193  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 
741 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
753 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
788 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 
759 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
712 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 
670 aa  191  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
733 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 
737 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
729 aa  190  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
773 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 
784 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 
720 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
771 aa  188  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 
736 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 
771 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
764 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
732 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 
732 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.73 
 
 
859 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
764 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 
728 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
743 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
762 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
774 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 
766 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 
817 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
743 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.05 
 
 
755 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 
809 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 
680 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
734 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 
822 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
710 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 
763 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
777 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
741 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
771 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
767 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
778 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
733 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27 
 
 
723 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 
703 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
685 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 
843 aa  174  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>