More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2677 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 759 aa  1541    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 		 763 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 771 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 704 aa  335  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 730 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 720 aa  317  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 732 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 725 aa  313  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 747 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 767 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 737 aa  306  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 758 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 730 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 743 aa  301  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 761 aa  301  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 722 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 764 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 726 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 785 aa  297  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 803 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 710 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 773 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 700 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 779 aa  293  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 755 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 771 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 743 aa  288  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 755 aa  288  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 722 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 765 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 748 aa  283  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 784 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 783 aa  281  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 763 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 746 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 766 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 776 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 796 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.88 
 
 		 739 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 761 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 723 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 741 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 789 aa  270  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 713 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 782 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 755 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 733 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 794 aa  266  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 775 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 733 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.95 
 
 		 754 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 749 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 758 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 734 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 761 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 790 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 780 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 731 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 771 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 736 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 860 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 764 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 817 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 764 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 756 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 764 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 773 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 776 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 724 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 769 aa  253  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 753 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 773 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 758 aa  251  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 867 aa  251  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 757 aa  251  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 731 aa  250  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 822 aa  249  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 774 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 744 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 726 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 777 aa  248  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 738 aa  246  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 777 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 784 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 787 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.25 
 
 		 755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 730 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  28.55 
 
 		 789 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 779 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 780 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 763 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 726 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 792 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 807 aa  241  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 751 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 717 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>