More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3857 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  57.73 
 
 		 745 aa  811    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 743 aa  1498    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  44.33 
 
 		 786 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  47.33 
 
 		 771 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  42.97 
 
 		 770 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 		 759 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  40.73 
 
 		 758 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  41.15 
 
 		 758 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  40.81 
 
 		 758 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 		 758 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  38.9 
 
 		 750 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 774 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 792 aa  445  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 728 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  35.19 
 
 		 775 aa  359  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 761 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 803 aa  333  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 780 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 792 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 761 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 780 aa  313  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 790 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 765 aa  308  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 730 aa  306  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 790 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 785 aa  296  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 769 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 780 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 720 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 832 aa  291  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 755 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 741 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 784 aa  284  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 730 aa  283  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 784 aa  281  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.55 
 
 		 739 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 710 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 804 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 807 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 704 aa  273  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 722 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 787 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 763 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 783 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 794 aa  264  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 746 aa  259  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 771 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 728 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  30.47 
 
 		 759 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 737 aa  251  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 753 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 749 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 726 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 771 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 729 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 771 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 776 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 779 aa  244  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 795 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 723 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 755 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 736 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 733 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 796 aa  236  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 764 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 779 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 722 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 764 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 734 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 766 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 764 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 730 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  30.3 
 
 		 807 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 747 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 777 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 808 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 779 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 764 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 777 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 731 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 717 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 782 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 738 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 808 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.84 
 
 		 751 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 762 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.59 
 
 		 754 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  29.42 
 
 		 797 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 725 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 809 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 759 aa  220  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 695 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 817 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 773 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 771 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>