More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3080 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 710 aa  1433    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  45.44 
 
 		 741 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  42.82 
 
 		 736 aa  528  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  39.81 
 
 		 749 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 730 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 704 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  36.42 
 
 		 739 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 783 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 803 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 761 aa  323  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 780 aa  321  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 775 aa  319  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 728 aa  316  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 790 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 720 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 769 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 758 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 792 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 761 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 765 aa  297  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 771 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 726 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 734 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 722 aa  290  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 695 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 729 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 732 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 730 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 780 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 817 aa  281  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 723 aa  280  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 758 aa  278  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 763 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 766 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 758 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 713 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 730 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 722 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 750 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 726 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 756 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 759 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 755 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 744 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 730 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 743 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 717 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 790 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 764 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 776 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 758 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 728 aa  264  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 777 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 758 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 784 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 758 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 784 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 759 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 733 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 786 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 779 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 730 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 731 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  30.64 
 
 		 747 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 724 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 771 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  29.36 
 
 		 748 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 751 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 764 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 743 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 764 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 753 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.2 
 
 		 754 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 753 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 747 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 779 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 796 aa  243  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 832 aa  243  7e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  29.14 
 
 		 715 aa  243  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 758 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 808 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 762 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 804 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 794 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 726 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 763 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 808 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 790 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 803 aa  236  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 778 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 778 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 794 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 790 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 690 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 732 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 767 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 755 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 796 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>