More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1776 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 734 aa  1502    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 723 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 730 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 729 aa  326  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 704 aa  313  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 762 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 732 aa  303  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 710 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 763 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 720 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 790 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 739 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 792 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 728 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 761 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 766 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 817 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 780 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 749 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 758 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 756 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 741 aa  270  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 731 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 736 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 780 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 783 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 784 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 753 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 728 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 725 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 790 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 726 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 775 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 747 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 787 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  29.24 
 
 		 748 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 730 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 784 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 764 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 724 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 803 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 790 aa  251  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 779 aa  250  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 751 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 838 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 744 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 771 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 825 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 790 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 780 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 767 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 733 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 730 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 779 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 776 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 809 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 785 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 808 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 737 aa  240  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 690 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 789 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 773 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 764 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 759 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 758 aa  236  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.55 
 
 		 715 aa  236  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 864 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 763 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 743 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 764 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 755 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 722 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 785 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 690 aa  231  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 778 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 779 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 786 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 800 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 800 aa  229  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 753 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 726 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 755 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.85 
 
 		 755 aa  227  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 743 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 700 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 773 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 745 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 814 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 717 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 695 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 780 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 757 aa  224  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 778 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 758 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  39.18 
 
 		 487 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>