More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0271 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  60.35 
 
 		 803 aa  940    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  64.22 
 
 		 786 aa  958    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  62.53 
 
 		 778 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  49.2 
 
 		 771 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  64.3 
 
 		 767 aa  980    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 790 aa  1593    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  96.08 
 
 		 790 aa  1465    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  61.9 
 
 		 778 aa  963    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  42.29 
 
 		 800 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  42.29 
 
 		 800 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 773 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 756 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 734 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 808 aa  402  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 835 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 814 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 815 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 832 aa  321  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 873 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 854 aa  313  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 851 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 855 aa  297  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 848 aa  297  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 720 aa  296  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 833 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  31.63 
 
 		 755 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  31.06 
 
 		 878 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 761 aa  273  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 734 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 797 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 722 aa  250  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 780 aa  248  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 732 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 757 aa  247  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 763 aa  246  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 790 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 763 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 794 aa  244  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 903 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 798 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 747 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 764 aa  237  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 862 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 864 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 751 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 777 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 862 aa  229  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 773 aa  227  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 736 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 792 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 755 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 722 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 783 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 769 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 860 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 741 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 880 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 803 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 851 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 838 aa  221  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 788 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 755 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 783 aa  220  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 763 aa  220  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 773 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 729 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 717 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 761 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 817 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 780 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 783 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 764 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 797 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 704 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 780 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 790 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 799 aa  211  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 730 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.46 
 
 		 715 aa  210  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.08 
 
 		 739 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 728 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 796 aa  207  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 815 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 804 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 785 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 723 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 784 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 788 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 745 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 794 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 762 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 771 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 779 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>