More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4329 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 734 aa  1491    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  67.56 
 
 		 773 aa  982    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  95.91 
 
 		 756 aa  1444    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 786 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  37.73 
 
 		 778 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  38.99 
 
 		 767 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 778 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  37.93 
 
 		 803 aa  462  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 790 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 790 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 771 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 800 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 800 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 835 aa  253  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 833 aa  235  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 808 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 854 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 815 aa  218  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 814 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 855 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 851 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 848 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 720 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 832 aa  200  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 761 aa  191  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 873 aa  187  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 736 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.74 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 690 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 741 aa  177  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 747 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 690 aa  174  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 780 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 777 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 764 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 784 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 794 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 729 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 741 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 710 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 717 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 788 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  24.58 
 
 		 878 aa  157  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.6 
 
 		 739 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 749 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 769 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 734 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 730 aa  150  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 763 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 723 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 722 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 765 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 713 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 687 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 757 aa  141  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 797 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 763 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 796 aa  137  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 704 aa  137  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 769 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 790 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.26 
 
 		 776 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 745 aa  134  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 755 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 817 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 728 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.7 
 
 		 685 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 783 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 777 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 771 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 780 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 803 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 763 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 783 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 730 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 775 aa  129  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 751 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  25.5 
 
 		 839 aa  128  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 838 aa  127  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.04 
 
 		 715 aa  127  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 779 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 776 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 815 aa  127  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 793 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 787 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 764 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 780 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 798 aa  124  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 771 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 851 aa  123  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 788 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 783 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  23.93 
 
 		 754 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 796 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 728 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 804 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 773 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>