More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0750 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 690 aa  1407    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  97.97 
 
 		 690 aa  1385    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  40.6 
 
 		 720 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.77 
 
 		 715 aa  265  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 851 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 853 aa  243  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 749 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 729 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 734 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 729 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 741 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 704 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 724 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 736 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 695 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 733 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 720 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 803 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 729 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 732 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 757 aa  213  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 767 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 763 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 732 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 687 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 748 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 713 aa  211  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 743 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 712 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 744 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 751 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 694 aa  203  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 743 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 733 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 744 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 722 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.87 
 
 		 739 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 703 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 780 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 736 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 778 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 747 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 794 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 713 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 722 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 778 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 783 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 731 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 743 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 725 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 762 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 763 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 666 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 732 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 759 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 720 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 730 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 790 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 728 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 761 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 737 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 776 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  26.42 
 
 		 714 aa  183  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 670 aa  183  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 802 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 723 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 784 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 686 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 803 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 726 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 733 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 773 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 773 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 700 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 769 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 730 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 750 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 759 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 753 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 758 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 771 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 734 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 771 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 755 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 755 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 786 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 790 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 774 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 784 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 734 aa  174  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 761 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 702 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 756 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 792 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 758 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>