More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1526 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  74.45 
 
 		 743 aa  1139    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  74.79 
 
 		 744 aa  1116    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  77.54 
 
 		 733 aa  1113    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  73.63 
 
 		 743 aa  1127    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  71.55 
 
 		 712 aa  1070    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  69.44 
 
 		 713 aa  1066    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  69.65 
 
 		 736 aa  1078    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  68.43 
 
 		 729 aa  1063    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  74.04 
 
 		 744 aa  1134    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  68.12 
 
 		 744 aa  1024    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  67.03 
 
 		 730 aa  1041    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  75.35 
 
 		 729 aa  1103    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  74.46 
 
 		 732 aa  1152    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  68.43 
 
 		 748 aa  1051    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 733 aa  1511    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  68.43 
 
 		 757 aa  1051    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  37.48 
 
 		 726 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  40.06 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  34.37 
 
 		 714 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 696 aa  340  8e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 690 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 851 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 853 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.97 
 
 		 715 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 695 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 728 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 783 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 765 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 761 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 729 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 720 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 713 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 687 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 734 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 753 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 762 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 802 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 732 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 695 aa  159  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 764 aa  157  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 747 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 732 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 773 aa  152  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 763 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 710 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 700 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 755 aa  150  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 767 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 761 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 769 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 753 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 794 aa  145  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 704 aa  144  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 771 aa  144  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 703 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 759 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  23.98 
 
 		 829 aa  142  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 718 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 751 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 641 aa  141  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 763 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 710 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 773 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 775 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 803 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 736 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 670 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 777 aa  138  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 685 aa  138  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 731 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  26.01 
 
 		 685 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.79 
 
 		 755 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 719 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 763 aa  136  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 795 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 694 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 722 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  24.18 
 
 		 692 aa  134  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 771 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 737 aa  134  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 778 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 731 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 747 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 712 aa  132  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 724 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 741 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 771 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 723 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 686 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 685 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 750 aa  130  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  24.03 
 
 		 687 aa  130  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 		 771 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 713 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>