More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1886 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  73.21 
 
 		 744 aa  1073    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  72.02 
 
 		 733 aa  1037    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  75.24 
 
 		 712 aa  1132    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  81.14 
 
 		 736 aa  1218    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 729 aa  1494    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  64.71 
 
 		 730 aa  1004    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  71.53 
 
 		 743 aa  1095    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  73.31 
 
 		 729 aa  1050    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  61.38 
 
 		 744 aa  926    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  71.02 
 
 		 744 aa  1090    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  76.45 
 
 		 713 aa  1145    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  70.55 
 
 		 732 aa  1085    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  64.48 
 
 		 748 aa  999    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  68.43 
 
 		 733 aa  1063    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  70.8 
 
 		 743 aa  1089    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  64.21 
 
 		 757 aa  996    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  40.7 
 
 		 697 aa  514  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  39.2 
 
 		 726 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  34.32 
 
 		 714 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 687 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 696 aa  333  8e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 853 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 851 aa  238  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 690 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 690 aa  226  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 720 aa  221  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 695 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 729 aa  194  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.92 
 
 		 715 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 728 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 763 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 687 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 747 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 713 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 704 aa  170  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 710 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 761 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 783 aa  167  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 695 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 741 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 720 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 762 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 753 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 794 aa  162  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 732 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 702 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 751 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 763 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 710 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 753 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 767 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 775 aa  154  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 741 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 686 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 761 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 749 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 736 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 641 aa  150  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 731 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 726 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.2 
 
 		 755 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 769 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 803 aa  147  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 737 aa  147  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 724 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 802 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 759 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 777 aa  144  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 773 aa  144  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 730 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 767 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 786 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 782 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 712 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 750 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 694 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 726 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 778 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 713 aa  141  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 758 aa  140  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 763 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 722 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 764 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 754 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 746 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 733 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 774 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 758 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 771 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 694 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 792 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 766 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>