More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4179 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 782 aa  1589    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  38.54 
 
 		 764 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  37.6 
 
 		 772 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 730 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  36.09 
 
 		 779 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 743 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 		 774 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  33.99 
 
 		 733 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 789 aa  328  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 773 aa  323  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 789 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 763 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 730 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 803 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 756 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 771 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 732 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 775 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 704 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 759 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 780 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 743 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 761 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 777 aa  241  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 765 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 766 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 722 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 726 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 720 aa  237  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 822 aa  236  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.47 
 
 		 695 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 737 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 790 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 743 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 710 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 755 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 860 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 747 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 857 aa  222  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 723 aa  220  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 739 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 780 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 810 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 755 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 773 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 722 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 771 aa  218  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 767 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 773 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 713 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 730 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 780 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 757 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 794 aa  207  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 783 aa  207  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 779 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 807 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 859 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 764 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 797 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  27.46 
 
 		 738 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 763 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.89 
 
 		 747 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 786 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.87 
 
 		 755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 807 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 713 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 702 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 761 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 746 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 784 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 764 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 771 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 796 aa  194  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 769 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 735 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.63 
 
 		 797 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 731 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 785 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 769 aa  190  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 758 aa  190  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 792 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 734 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 791 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 794 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 758 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 780 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 790 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>