More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3344 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 791 aa  1600    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 857 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 777 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 758 aa  266  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 771 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 755 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 756 aa  250  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 763 aa  236  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 759 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 767 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 810 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 704 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 743 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 773 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 730 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 859 aa  211  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 783 aa  211  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 794 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 803 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 764 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 722 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 761 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 771 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 797 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 773 aa  200  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 782 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 774 aa  197  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 773 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 790 aa  194  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 755 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 761 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 809 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 729 aa  191  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 863 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 860 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 758 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 776 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 765 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 773 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 764 aa  184  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 808 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 790 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 790 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 775 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 851 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 777 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 867 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 796 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 750 aa  178  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 796 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25.97 
 
 		 751 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 733 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 792 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 780 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 741 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 792 aa  174  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 780 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 779 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 772 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 789 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 817 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 723 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 807 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 862 aa  171  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 766 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 784 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 730 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 748 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 725 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  26.6 
 
 		 738 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 769 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  24.85 
 
 		 789 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 713 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 799 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 746 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 795 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 780 aa  164  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 767 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 758 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.84 
 
 		 755 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 774 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 761 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 787 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 741 aa  157  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 738 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 825 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 785 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 739 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 776 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  24.39 
 
 		 839 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 832 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 741 aa  152  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>