More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3027 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  53.36 
 
 		 860 aa  904    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  53.7 
 
 		 859 aa  912    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  53.58 
 
 		 867 aa  850    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 851 aa  1731    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 780 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 807 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 780 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 790 aa  379  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 803 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 792 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 765 aa  357  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 790 aa  356  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 755 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 832 aa  342  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 776 aa  335  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 761 aa  334  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 794 aa  269  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 784 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 764 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 775 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 783 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 730 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 817 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 856 aa  234  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 758 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 769 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 756 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 755 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 779 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 782 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 780 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 759 aa  201  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.75 
 
 		 751 aa  200  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 806 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 843 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.26 
 
 		 754 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 789 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 783 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 850 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 785 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 808 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 764 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 741 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 822 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 873 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 807 aa  177  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 824 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 825 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 795 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 773 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 774 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 767 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  49.71 
 
 		 753 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 704 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 797 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 791 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 710 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  24.42 
 
 		 807 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 855 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 796 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  43.64 
 
 		 761 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 738 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 720 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 730 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 754 aa  156  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 857 aa  156  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  40.18 
 
 		 787 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 795 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 919 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 744 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 772 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 786 aa  154  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  35.32 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 903 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 745 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  42.35 
 
 		 743 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 862 aa  151  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 784 aa  152  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 854 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  36.11 
 
 		 796 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 750 aa  149  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 792 aa  147  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3419  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 358 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 812 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  41.99 
 
 		 809 aa  147  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 985 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 736 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 729 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  44.15 
 
 		 773 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 758 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 863 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  43.09 
 
 		 804 aa  144  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 767 aa  144  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  37.79 
 
 		 728 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  32.39 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>