More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3281 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  70.12 
 
 		 807 aa  1111    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 797 aa  1598    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  35.83 
 
 		 763 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 804 aa  360  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  31.39 
 
 		 759 aa  313  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 779 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 787 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 771 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 794 aa  286  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 784 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 858 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 730 aa  270  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 761 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 853 aa  265  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 784 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 761 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 780 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 765 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 730 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 720 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 780 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 799 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 765 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 790 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 728 aa  220  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 790 aa  220  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 741 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 728 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 792 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 783 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 785 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 733 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 777 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 782 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 764 aa  207  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 		 739 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 722 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 775 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 803 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 726 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 749 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 856 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 763 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 755 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 		 850 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 797 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 796 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 759 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 786 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 751 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 771 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 807 aa  185  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 776 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 825 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 752 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 717 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 774 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 778 aa  179  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 796 aa  179  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 758 aa  178  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.07 
 
 		 741 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 758 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 758 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 762 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 817 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 778 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 851 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 767 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 773 aa  173  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 746 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 737 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 808 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 780 aa  171  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 745 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 729 aa  171  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 733 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 767 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 753 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 919 aa  167  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 795 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 753 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 730 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 771 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 773 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 773 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 755 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 800 aa  160  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 800 aa  160  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 743 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 971 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 769 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 860 aa  157  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 797 aa  157  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>