More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3453 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 856 aa  1744    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  40.27 
 
 		 796 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 803 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 790 aa  324  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 761 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 765 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 832 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 780 aa  303  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 859 aa  303  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 860 aa  303  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 790 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 761 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 792 aa  293  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 867 aa  286  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 780 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 755 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 794 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 722 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 807 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 783 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 854 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 784 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 776 aa  250  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 775 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 787 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 786 aa  241  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 851 aa  240  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 720 aa  237  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 771 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 764 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 779 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 746 aa  227  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 785 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 759 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 704 aa  224  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 817 aa  223  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.13 
 
 		 754 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 758 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 758 aa  221  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 784 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 807 aa  221  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 763 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 764 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 753 aa  217  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 734 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 779 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 758 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 730 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 750 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.64 
 
 		 747 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 751 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 730 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 779 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 790 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 737 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 780 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 739 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 802 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 808 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  27.23 
 
 		 797 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 756 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 812 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 774 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 744 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 749 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 759 aa  202  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 773 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 809 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 786 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 758 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 822 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 806 aa  196  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  27.39 
 
 		 763 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.6 
 
 		 741 aa  194  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 782 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 807 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 710 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 764 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 725 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 729 aa  190  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 838 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  27.84 
 
 		 850 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 825 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 773 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 772 aa  187  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 785 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 789 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 774 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 863 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 777 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 767 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.75 
 
 		 767 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 753 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 795 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 759 aa  183  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>