More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3469 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 824 aa  1685    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  53.21 
 
 		 843 aa  808    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  55.62 
 
 		 840 aa  865    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 817 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 769 aa  270  7e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 780 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 730 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 790 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 779 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 783 aa  222  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 775 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 784 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 749 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 825 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 704 aa  213  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.37 
 
 		 747 aa  211  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 776 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.3 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 769 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 809 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 838 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 757 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 734 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 763 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 741 aa  200  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 722 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 787 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 822 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 720 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 788 aa  197  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 803 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 864 aa  194  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 722 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 780 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 919 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 710 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 758 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 789 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 		 739 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 808 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 782 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 851 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 797 aa  183  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 743 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 758 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 		 695 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 766 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 744 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 753 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 790 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 761 aa  180  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 733 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 792 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 736 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 730 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 786 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 713 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 751 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 779 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 723 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 832 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 775 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  24.81 
 
 		 754 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 814 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 785 aa  170  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 735 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 726 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 764 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 817 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 764 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 873 aa  168  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 730 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 747 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 758 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 743 aa  167  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 		 789 aa  167  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 745 aa  167  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 755 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 730 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 783 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 774 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 797 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 761 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 896 aa  164  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 726 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 851 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 773 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 767 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 765 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 732 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 780 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 807 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>