More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3048 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 790 aa  1608    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  44.43 
 
 		 764 aa  608  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  44.52 
 
 		 779 aa  602  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  41.15 
 
 		 785 aa  572  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  42.61 
 
 		 767 aa  552  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  41.15 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 773 aa  519  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 795 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 784 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  36.24 
 
 		 863 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 810 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 822 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 771 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 777 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 743 aa  263  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 758 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 756 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 720 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 741 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 737 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 857 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 732 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 763 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 767 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 755 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 780 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 797 aa  218  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 792 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 710 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 838 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 736 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 734 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 761 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 730 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 803 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 766 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 751 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 761 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 822 aa  207  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 764 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 757 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 743 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 790 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 785 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 722 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 759 aa  200  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 723 aa  200  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 856 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 919 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 748 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 704 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 726 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 775 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 807 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 730 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 741 aa  193  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 753 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 769 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 739 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 771 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 765 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 808 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 802 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 864 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 782 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 733 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 773 aa  189  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 746 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 724 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 780 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 784 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 784 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 728 aa  187  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 771 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 832 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 773 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 773 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 775 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 791 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 840 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 777 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 752 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 755 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 807 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 776 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 		 754 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 754 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 761 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 753 aa  179  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 734 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>