More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2433 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 704 aa  1426    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 730 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 710 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 741 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 761 aa  356  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  33.05 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 765 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 		 790 aa  344  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 803 aa  336  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 780 aa  334  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 783 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 792 aa  331  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 755 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 723 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 771 aa  323  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 732 aa  321  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 720 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 736 aa  318  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 729 aa  316  8e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 758 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 749 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 775 aa  313  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 790 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 722 aa  310  8e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 728 aa  308  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 747 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 784 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 728 aa  303  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 759 aa  300  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 761 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 763 aa  298  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 734 aa  297  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 780 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 764 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  32.6 
 
 		 695 aa  295  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 766 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 785 aa  290  9e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 753 aa  286  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 771 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 817 aa  283  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 776 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 783 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 779 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 731 aa  281  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 726 aa  280  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 758 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 777 aa  274  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 764 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 726 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 730 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 743 aa  270  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 786 aa  270  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 743 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 722 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 784 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 724 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 717 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 769 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 762 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 735 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 787 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 756 aa  264  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 753 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 757 aa  263  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 771 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 754 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 764 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 744 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 751 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 738 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 776 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 758 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 758 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 794 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 745 aa  250  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 780 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 771 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 773 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 873 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 700 aa  247  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 779 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 713 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 731 aa  246  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28 
 
 		 755 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.97 
 
 		 741 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 773 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  29.57 
 
 		 715 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 733 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 755 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 774 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 720 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 794 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 732 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>