More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0230 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 729 aa  1499    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 723 aa  331  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 762 aa  325  2e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 704 aa  316  9e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 734 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 764 aa  289  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 710 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 792 aa  283  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 780 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 790 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 732 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 731 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 763 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 783 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 776 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 765 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 730 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 730 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 747 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 761 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 703 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 789 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 743 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 753 aa  250  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 741 aa  250  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 745 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 751 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 755 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 759 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 739 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 803 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 717 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 771 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 786 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 730 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 720 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 784 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 817 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 780 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 758 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 749 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  30.17 
 
 		 741 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 728 aa  241  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 777 aa  240  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 750 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 733 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 862 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 722 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 761 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 775 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 792 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 780 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 794 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 732 aa  234  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 758 aa  234  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 735 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 809 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 733 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 722 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 736 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 758 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 807 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 794 aa  229  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 726 aa  230  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 775 aa  229  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 784 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 751 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 780 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 771 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 758 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 773 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 743 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 764 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 808 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 771 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 770 aa  225  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 825 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 773 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 769 aa  225  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 785 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 755 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 728 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 803 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 773 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 787 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 759 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 767 aa  220  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 774 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 759 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 726 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 690 aa  217  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 761 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 822 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 790 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 790 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>