More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4257 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 755 aa  1536    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  41.15 
 
 		 803 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 790 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  40.58 
 
 		 792 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 761 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  39.64 
 
 		 832 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 807 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 		 765 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  36.86 
 
 		 790 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 		 780 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 780 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 867 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 776 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 761 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 860 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 859 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 851 aa  352  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 704 aa  333  7.000000000000001e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 796 aa  319  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 775 aa  315  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 753 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 730 aa  304  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 728 aa  301  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 783 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 730 aa  290  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 743 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 723 aa  287  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 771 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 787 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 730 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 856 aa  280  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 749 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 784 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 745 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 720 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 750 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 786 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 758 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 722 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 758 aa  272  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 758 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 710 aa  270  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 741 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 779 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 773 aa  266  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 817 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 728 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 771 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 732 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 754 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  31.64 
 
 		 759 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 794 aa  263  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 773 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 758 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 759 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 744 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 747 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 759 aa  254  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 780 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 804 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 736 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.49 
 
 		 733 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 751 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 729 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 774 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 763 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 751 aa  248  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 755 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.76 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 792 aa  243  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 771 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 766 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 741 aa  242  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 726 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 785 aa  241  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 764 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 770 aa  241  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 764 aa  238  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 753 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 764 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 771 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 755 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  28.77 
 
 		 763 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 809 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 731 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 726 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 773 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 775 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 808 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 730 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 756 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 734 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 794 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 806 aa  226  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 763 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 771 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 777 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>