More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1910 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 736 aa  1482    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  46.71 
 
 		 749 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  43.44 
 
 		 710 aa  545  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  41.21 
 
 		 741 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 730 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  34.34 
 
 		 739 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 704 aa  325  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 775 aa  315  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 780 aa  311  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 783 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 803 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 		 761 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 726 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 761 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 758 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 790 aa  286  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 771 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 730 aa  277  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 790 aa  277  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 780 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 766 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 731 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 722 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 792 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 726 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 765 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 784 aa  270  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 713 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 732 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 722 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 784 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 755 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 734 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 728 aa  260  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 763 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 759 aa  257  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 758 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 728 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 726 aa  255  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 750 aa  254  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 758 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 758 aa  254  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 779 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 730 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 758 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 753 aa  251  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 747 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.11 
 
 		 754 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 817 aa  248  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 776 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 778 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 804 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 778 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 794 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 796 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 822 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 757 aa  241  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 758 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 759 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 774 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 786 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 774 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 729 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 773 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 723 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 803 aa  235  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 717 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 771 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 762 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 775 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 764 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 773 aa  231  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.3 
 
 		 715 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 771 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 790 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 695 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 790 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 733 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.67 
 
 		 759 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 767 aa  227  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 787 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 763 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 744 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 786 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 788 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 724 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 746 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 808 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 730 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 794 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 735 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 761 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 745 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 790 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>