More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2882 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 786 aa  1577    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  49.87 
 
 		 770 aa  712    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  61.85 
 
 		 771 aa  892    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  45.82 
 
 		 745 aa  596  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  44.98 
 
 		 743 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 774 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 		 759 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 750 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 		 758 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 758 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 758 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 758 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 792 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 728 aa  395  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 775 aa  348  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 790 aa  307  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 761 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 803 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 761 aa  283  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 792 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 780 aa  277  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 730 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 704 aa  270  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 790 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 753 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 755 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 732 aa  266  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 780 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 720 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 749 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 765 aa  264  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 710 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 783 aa  250  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 780 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 769 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 741 aa  248  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 794 aa  247  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 729 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 722 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 784 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 728 aa  240  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 763 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  30.34 
 
 		 776 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.96 
 
 		 739 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 758 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 804 aa  231  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 736 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 856 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 796 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 762 aa  227  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 769 aa  226  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 832 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 751 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 741 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 730 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 771 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 734 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.2 
 
 		 747 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 817 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 808 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 771 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 764 aa  216  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 725 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 785 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 809 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 777 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 730 aa  214  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 730 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.94 
 
 		 759 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 794 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.16 
 
 		 754 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 873 aa  207  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.89 
 
 		 751 aa  207  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 733 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 825 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 780 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 779 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 782 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.87 
 
 		 755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 724 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 746 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 774 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 808 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 723 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 761 aa  197  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 737 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 755 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 753 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 747 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 794 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 713 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 771 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 773 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 777 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 767 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>