More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3147 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 775 aa  1565    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 761 aa  361  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 743 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 786 aa  356  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  34.63 
 
 		 803 aa  331  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 710 aa  324  5e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 704 aa  323  6e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 755 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 771 aa  320  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 761 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 730 aa  314  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 784 aa  310  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 736 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 745 aa  308  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 790 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 792 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  31.58 
 
 		 739 aa  300  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 720 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 780 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 765 aa  290  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 794 aa  286  8e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 747 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 728 aa  284  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 741 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 783 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 790 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 759 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 758 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 758 aa  277  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 832 aa  276  9e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 753 aa  275  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 787 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 785 aa  271  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 771 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 722 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 807 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 728 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 773 aa  262  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 780 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 749 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 782 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 773 aa  261  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 851 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 758 aa  260  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 732 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 746 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 860 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 796 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 817 aa  257  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 769 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 794 aa  255  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 723 aa  253  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 764 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 763 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 814 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 796 aa  250  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 724 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 862 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 755 aa  247  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 780 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 758 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 729 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 784 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 770 aa  245  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 779 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 808 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 695 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 750 aa  241  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 737 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  29.16 
 
 		 715 aa  240  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 789 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 735 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 804 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 856 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 792 aa  238  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 702 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 807 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 774 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 860 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 795 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 777 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 759 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 774 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 808 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 854 aa  231  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 775 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 903 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 731 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 812 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.47 
 
 		 751 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 726 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.07 
 
 		 748 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 764 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 880 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 777 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>