More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3795 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  46.79 
 
 		 860 aa  778    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  62.06 
 
 		 862 aa  1076    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 880 aa  1798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  31.93 
 
 		 906 aa  359  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  30.44 
 
 		 839 aa  315  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 815 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 896 aa  307  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 903 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 864 aa  263  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 780 aa  258  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 838 aa  257  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 862 aa  248  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 919 aa  233  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 808 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 775 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 780 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 835 aa  205  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 803 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 774 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 796 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 759 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 792 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 783 aa  190  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 800 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 800 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 762 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 778 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 761 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 803 aa  185  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 851 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 778 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 809 aa  184  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 758 aa  184  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 758 aa  184  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 758 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 776 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 767 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 745 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 786 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 763 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  24.77 
 
 		 776 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 758 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 797 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 755 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 774 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 783 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 741 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 710 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 777 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 832 aa  171  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 797 aa  170  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 783 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 790 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 832 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 750 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 829 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 785 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 771 aa  168  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 729 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 790 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 790 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 855 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 757 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 779 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 728 aa  163  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 761 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 873 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 732 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 867 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 848 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 792 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 854 aa  158  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 765 aa  157  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 833 aa  156  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  31.55 
 
 		 755 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 807 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 764 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 790 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 704 aa  155  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 775 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 814 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 858 aa  154  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 746 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 739 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 815 aa  153  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  24.04 
 
 		 786 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 770 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 926 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 809 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 		 749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 784 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 758 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 796 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>