More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2405 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 786 aa  1569    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0346  TonB-dependent receptor  42.18 
 
 		 836 aa  538  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  37.22 
 
 		 926 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  37.09 
 
 		 783 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4852  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 772 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 929 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03469  Outer membrane protein  30.25 
 
 		 760 aa  313  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 783 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 710 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 737 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 743 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 745 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 765 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 862 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 860 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 728 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.02 
 
 		 809 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 764 aa  175  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 864 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 776 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 762 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 758 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 731 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 906 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 770 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 783 aa  163  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 739 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 722 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 758 aa  160  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 838 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 903 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 777 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 810 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 780 aa  157  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 741 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 867 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 766 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 803 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 919 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 797 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 758 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 744 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 761 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 725 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 758 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 750 aa  150  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  24.78 
 
 		 862 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 769 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 817 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 774 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 748 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 798 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 780 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 786 aa  148  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 758 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 722 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 764 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 758 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 787 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 780 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 775 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 822 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 808 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 726 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 763 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 803 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 784 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 807 aa  141  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  25.78 
 
 		 763 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 785 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 777 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 773 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 815 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 799 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 704 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 773 aa  138  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 806 aa  138  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 735 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 790 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 790 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 769 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 792 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 695 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 733 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 777 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 796 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 775 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 783 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 729 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 839 aa  132  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 969 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>