More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3067 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 903 aa  1831    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 		 815 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  49.9 
 
 		 896 aa  469  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  34.94 
 
 		 906 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 864 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 838 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 862 aa  354  5e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 860 aa  341  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 919 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 862 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 880 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 808 aa  291  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 		 839 aa  291  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 796 aa  267  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 848 aa  267  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 855 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 873 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 851 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 803 aa  253  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 767 aa  252  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 790 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 790 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  29.14 
 
 		 878 aa  240  9e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 817 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 739 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 814 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 854 aa  237  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 763 aa  237  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 775 aa  231  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 769 aa  230  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 798 aa  227  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 800 aa  226  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 800 aa  226  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 778 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 780 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 776 aa  221  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.73 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 704 aa  219  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 778 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 766 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 777 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 790 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 835 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 783 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 749 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 758 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 726 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 783 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 722 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 736 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.8 
 
 		 776 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 783 aa  204  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 797 aa  204  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 745 aa  204  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 728 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 784 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 803 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 792 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 822 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 757 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 779 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 815 aa  199  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 797 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 747 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 723 aa  197  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 700 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  28.67 
 
 		 747 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 729 aa  194  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 761 aa  194  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 809 aa  189  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 720 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 832 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 702 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 765 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 773 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 764 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 734 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 771 aa  184  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 780 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 785 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 786 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 776 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 755 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 744 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 759 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 809 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 713 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 761 aa  179  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 783 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 751 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 798 aa  178  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  35.54 
 
 		 758 aa  177  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>