More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3141 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  53.94 
 
 		 832 aa  850    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 815 aa  1660    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  45.22 
 
 		 833 aa  639    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 835 aa  364  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 808 aa  330  7e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 803 aa  329  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 790 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 767 aa  324  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 790 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 778 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 778 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 786 aa  299  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 771 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 814 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 800 aa  278  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 800 aa  278  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 873 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 851 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 848 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 854 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 756 aa  231  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 855 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 773 aa  224  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 734 aa  218  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 720 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 838 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 851 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 797 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 761 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 903 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  25.28 
 
 		 878 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 864 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 732 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 783 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.03 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 780 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 783 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 796 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 741 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 862 aa  168  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 722 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 763 aa  165  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 797 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 704 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  24.63 
 
 		 839 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  30.68 
 
 		 906 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 896 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.1 
 
 		 739 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 759 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 798 aa  161  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 730 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 862 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2554  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 861 aa  159  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 775 aa  159  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 728 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 815 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 741 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 769 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 817 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 749 aa  154  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 765 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 763 aa  153  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 880 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 790 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 761 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 728 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 747 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 860 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 803 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 780 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 773 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 784 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 771 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 734 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 919 aa  144  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 773 aa  144  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 780 aa  144  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 757 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 723 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 787 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 736 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 690 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 856 aa  141  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 748 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 777 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 769 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 792 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 755 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 776 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.31 
 
 		 715 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 784 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 790 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 771 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 717 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 690 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 710 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 784 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 794 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 788 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>