More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3029 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 919 aa  1861    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 862 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 864 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  37.95 
 
 		 838 aa  496  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  34.92 
 
 		 839 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 906 aa  347  8e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 903 aa  328  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 896 aa  327  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 796 aa  290  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 815 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 862 aa  277  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 860 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 808 aa  253  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 777 aa  243  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 769 aa  241  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 763 aa  234  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 822 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 761 aa  228  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 780 aa  228  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 880 aa  227  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 		 739 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 726 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 851 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 765 aa  210  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 776 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 775 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 832 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 855 aa  203  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 730 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 854 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 757 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 783 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 751 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 814 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 848 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 769 aa  195  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 730 aa  195  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 803 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 780 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 790 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 790 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 780 aa  193  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 764 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 873 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 797 aa  191  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 717 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 767 aa  190  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 797 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 783 aa  189  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 780 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 786 aa  187  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 798 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.92 
 
 		 755 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 790 aa  186  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 783 aa  184  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  28.01 
 
 		 809 aa  182  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 734 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 824 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 867 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 778 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 790 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 778 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 720 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 795 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 710 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 722 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 779 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 785 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 755 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 786 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 843 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 800 aa  173  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 800 aa  173  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 759 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 771 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 756 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 747 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 764 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 753 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 796 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 749 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 840 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 784 aa  168  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 807 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  24.21 
 
 		 878 aa  165  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 835 aa  165  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 704 aa  164  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 744 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 804 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 789 aa  163  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 741 aa  162  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 762 aa  162  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 777 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 794 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 761 aa  160  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 766 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 743 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>