More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5026 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 794 aa  1618    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  47.78 
 
 		 796 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  43.64 
 
 		 789 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  37.59 
 
 		 808 aa  469  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 812 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 735 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 829 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 759 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  31.47 
 
 		 747 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 744 aa  277  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 766 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 730 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 738 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 807 aa  248  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 758 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 		 726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 737 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 710 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 771 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 741 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 722 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 704 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.79 
 
 		 739 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 785 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 783 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 761 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 780 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 794 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 732 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 775 aa  210  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 733 aa  211  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 743 aa  208  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 745 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 720 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 759 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 784 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 764 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 755 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 755 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 817 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 729 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 743 aa  197  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 776 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 796 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 730 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 747 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 731 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 736 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 723 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 786 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 790 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 896 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 784 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 777 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 757 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 773 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 779 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 758 aa  191  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 731 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 730 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 814 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 733 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 725 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 726 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 756 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 794 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 782 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 734 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 775 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 722 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 792 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 822 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 789 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 771 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 728 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 809 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 771 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 767 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 761 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 724 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 777 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 762 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 773 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 749 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 788 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 864 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 771 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 769 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 769 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 838 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 795 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 789 aa  167  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 754 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 755 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 796 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 773 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>