More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3653 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 771 aa  1572    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  57.77 
 
 		 759 aa  864    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  41.69 
 
 		 804 aa  568  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 779 aa  492  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 799 aa  347  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  31.82 
 
 		 763 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  32.02 
 
 		 807 aa  323  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 784 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  31.23 
 
 		 797 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 790 aa  299  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 730 aa  298  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 790 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 858 aa  295  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 780 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 761 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 787 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 761 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 784 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 794 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 792 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 745 aa  271  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 780 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 755 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 765 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 710 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 764 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 720 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 741 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 749 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 765 aa  250  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 817 aa  249  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 728 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 730 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 776 aa  246  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 783 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 754 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 704 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 726 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 753 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 758 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 769 aa  237  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 777 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 775 aa  235  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 750 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 780 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 758 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 731 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 728 aa  231  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 766 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 774 aa  230  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 758 aa  230  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 771 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 786 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 724 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 773 aa  227  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 747 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 759 aa  224  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 809 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 732 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 736 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 775 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.85 
 
 		 741 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 733 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 729 aa  218  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 763 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 751 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 758 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 792 aa  211  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 773 aa  211  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 771 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 764 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 755 aa  210  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 722 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 783 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 796 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 797 aa  207  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 808 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 726 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 788 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 744 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 773 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 746 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 730 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 730 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 779 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 757 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 758 aa  197  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 769 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>