More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0895 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 769 aa  1580    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 730 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  34.4 
 
 		 739 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 758 aa  335  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 710 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 822 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 743 aa  280  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 741 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 785 aa  278  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 758 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 704 aa  267  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 747 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 732 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 775 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 745 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 764 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 786 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 733 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 726 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 720 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 759 aa  244  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 750 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 783 aa  243  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 748 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 744 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 717 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 736 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 761 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 785 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 803 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 728 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 860 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 743 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 795 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 720 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 759 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 769 aa  228  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 790 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 773 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 771 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 723 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 780 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 758 aa  224  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 766 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 749 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 725 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 761 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 735 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 809 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 771 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 765 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 792 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 763 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 758 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 		 754 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 779 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 803 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 774 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 808 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 756 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 867 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 722 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 789 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 851 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 759 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 794 aa  211  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 780 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 729 aa  211  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 780 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 775 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 780 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 790 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 730 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 777 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 807 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 734 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 784 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 767 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 777 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.91 
 
 		 733 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 724 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 808 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 873 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 778 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 796 aa  200  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 824 aa  200  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 728 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>