More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4274 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 758 aa  1530    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  36.56 
 
 		 739 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 730 aa  429  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 758 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 704 aa  320  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 766 aa  319  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 763 aa  319  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 710 aa  316  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 749 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 790 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 741 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 736 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 792 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  32.53 
 
 		 759 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 769 aa  282  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 783 aa  280  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 755 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 722 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  32.21 
 
 		 747 aa  275  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 761 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 776 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 790 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 747 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 730 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 744 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 803 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 761 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 789 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 771 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 779 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 808 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 775 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 725 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 726 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 759 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 728 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 780 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 728 aa  251  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 807 aa  249  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 757 aa  247  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 780 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 722 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 786 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 775 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 738 aa  243  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 851 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 731 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 784 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 765 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 746 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 758 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 807 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 764 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 796 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 774 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 743 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 771 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 785 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 745 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 755 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 822 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 737 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 730 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 796 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 794 aa  226  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 777 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 758 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 780 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 758 aa  224  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 825 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 700 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 717 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 832 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 732 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 758 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 720 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 759 aa  220  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 840 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 723 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 748 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 735 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 726 aa  218  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 743 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 862 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 713 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 758 aa  216  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 733 aa  216  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 782 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 767 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 762 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 695 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 753 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.75 
 
 		 755 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 903 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 774 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 733 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 937 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>