More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0730 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 761 aa  1554    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  41.84 
 
 		 807 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  39.95 
 
 		 755 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  38.78 
 
 		 803 aa  485  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 832 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 765 aa  432  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  34.79 
 
 		 780 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  35.55 
 
 		 790 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 792 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 790 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 780 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 867 aa  379  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 761 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 860 aa  364  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 776 aa  361  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  34.42 
 
 		 775 aa  357  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 859 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 851 aa  334  4e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 753 aa  329  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 796 aa  327  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 784 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 743 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 856 aa  303  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 794 aa  303  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 758 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 704 aa  299  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 783 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 710 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 758 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 758 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 758 aa  290  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 817 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 759 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 728 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 786 aa  283  9e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 741 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 736 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 787 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 728 aa  276  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 804 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 730 aa  276  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 720 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 750 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  29.43 
 
 		 751 aa  270  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 792 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  31.96 
 
 		 759 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  29.96 
 
 		 797 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 771 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 745 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 730 aa  260  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 754 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 774 aa  258  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 785 aa  257  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 779 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.92 
 
 		 748 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 755 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 732 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 771 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 775 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 758 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 730 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 695 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 780 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 764 aa  250  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 723 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 749 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.97 
 
 		 739 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  29.37 
 
 		 807 aa  243  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 773 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  31.96 
 
 		 763 aa  240  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 814 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 763 aa  240  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 770 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 751 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 729 aa  238  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 784 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 734 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 769 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 737 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 773 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 762 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 771 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 733 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 808 aa  233  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 743 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 726 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.95 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 779 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.64 
 
 		 715 aa  230  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 722 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 747 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 720 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 764 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 853 aa  228  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 767 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 777 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 733 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 778 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 796 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>