More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3336 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 741 aa  1488    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  45.44 
 
 		 710 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  40.29 
 
 		 736 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 		 749 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 730 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  35.88 
 
 		 739 aa  341  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 780 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 761 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 803 aa  320  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 722 aa  306  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 783 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 790 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 765 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 758 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 728 aa  296  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 790 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 720 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 763 aa  291  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 761 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 722 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 743 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 775 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 769 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 780 aa  276  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 771 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 726 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 730 aa  274  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 730 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 755 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 728 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.75 
 
 		 754 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 734 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 743 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 766 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 726 aa  266  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 747 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 777 aa  264  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 775 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 733 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 817 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 758 aa  250  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 786 aa  250  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 729 aa  250  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 764 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 822 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 784 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 717 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 762 aa  247  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 779 aa  247  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 750 aa  246  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 751 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 790 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 756 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 785 aa  245  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 771 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 753 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 779 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 764 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 758 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 759 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 771 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 726 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 808 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 773 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 744 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 763 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 732 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 789 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  31.27 
 
 		 733 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 796 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 773 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 753 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 771 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 759 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 746 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 725 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 771 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 784 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 759 aa  230  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 731 aa  230  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 773 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 776 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 788 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 758 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 808 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 764 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 776 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 724 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.52 
 
 		 809 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 773 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 771 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 794 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 794 aa  223  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>