More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1868 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  60.74 
 
 		 859 aa  1002    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 867 aa  1761    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  59.04 
 
 		 860 aa  959    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  52.84 
 
 		 851 aa  859    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 780 aa  442  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 832 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 792 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 803 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 755 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 790 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 761 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 790 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 780 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 765 aa  360  9e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 784 aa  287  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 856 aa  279  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 794 aa  268  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 787 aa  265  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 764 aa  258  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 817 aa  256  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 723 aa  247  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 784 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 807 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 780 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  43.51 
 
 		 776 aa  231  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 756 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 759 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 769 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 822 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 825 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 766 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 864 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 710 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 919 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 808 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 761 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 937 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 741 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 854 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 857 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 730 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 862 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 772 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 749 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 795 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  41.54 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 764 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 		 850 aa  173  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 791 aa  171  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 730 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 736 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 800 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 800 aa  163  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 880 aa  162  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 851 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 743 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 815 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 786 aa  157  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 783 aa  156  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  44.39 
 
 		 743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  41.31 
 
 		 704 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 862 aa  154  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 985 aa  154  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 730 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 		 771 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 744 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 729 aa  152  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  45.5 
 
 		 775 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 754 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  40.64 
 
 		 728 aa  151  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  35.51 
 
 		 755 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 969 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  39.19 
 
 		 797 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  40.74 
 
 		 804 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 764 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  35.62 
 
 		 796 aa  148  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 763 aa  148  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  33.68 
 
 		 763 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 896 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  33.22 
 
 		 751 aa  147  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 971 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  37.79 
 
 		 759 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 745 aa  145  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 792 aa  144  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.42 
 
 		 733 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 853 aa  144  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 720 aa  144  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  39.46 
 
 		 759 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  36.57 
 
 		 806 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 728 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  41.85 
 
 		 775 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 741 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  33.78 
 
 		 797 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  37.46 
 
 		 783 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 726 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 758 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>