More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0999 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 722 aa  1471    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 		 726 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  37.92 
 
 		 722 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  39.31 
 
 		 726 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 730 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 771 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  32.05 
 
 		 739 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 730 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 717 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 726 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 741 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 720 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 803 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 763 aa  277  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 749 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 710 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 725 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 759 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 755 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 704 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 773 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 736 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 776 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 728 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  31 
 
 		 747 aa  260  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 777 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 773 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 771 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 817 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 743 aa  253  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 822 aa  253  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 747 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 764 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 753 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 735 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 757 aa  251  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 730 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 732 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 775 aa  248  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 856 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 723 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 731 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 780 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.36 
 
 		 741 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 730 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 790 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 790 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 758 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 761 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 765 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 729 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 756 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 790 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 737 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 784 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 782 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 812 aa  236  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 733 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 783 aa  234  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 743 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 761 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 759 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 789 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 796 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 780 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 808 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 804 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 789 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 763 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 769 aa  225  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 743 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 755 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 767 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 786 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 780 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.3 
 
 		 695 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 832 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 746 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 744 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 788 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 794 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 787 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 790 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 733 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 792 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 767 aa  216  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 764 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 754 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 774 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 825 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 779 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 796 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 808 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 789 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 771 aa  214  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 803 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>