More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0277 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 775 aa  1583    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 777 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 795 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 854 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 817 aa  298  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 780 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 763 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 780 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 817 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1941  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 676 aa  258  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.891675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 741 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 765 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 783 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 761 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 776 aa  252  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 749 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 730 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 755 aa  244  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.99 
 
 		 739 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  29.92 
 
 		 763 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 775 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 790 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 704 aa  232  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 804 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 806 aa  230  7e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 761 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 729 aa  230  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 784 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 		 759 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 736 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 803 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 755 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 798 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 832 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 808 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 787 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 792 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 773 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 720 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 728 aa  222  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 794 aa  222  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 771 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.64 
 
 		 754 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 731 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 730 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 743 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 773 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 764 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 769 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 710 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 759 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 779 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 803 aa  211  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 789 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 744 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 771 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 790 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 777 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 748 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 737 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 725 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 785 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 753 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 822 aa  207  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 732 aa  207  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 751 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 758 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 753 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 759 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 758 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 747 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 766 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 794 aa  200  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.51 
 
 		 748 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 762 aa  197  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 738 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 774 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 803 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 786 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 695 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 814 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 723 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 730 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 774 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 726 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 825 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 724 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 730 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 808 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>