More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2663 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 728 aa  1480    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 		 771 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 710 aa  320  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  33.15 
 
 		 704 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 761 aa  297  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 741 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 761 aa  290  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 734 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 803 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 792 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 780 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 765 aa  280  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 722 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 790 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 780 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 755 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 730 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 747 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.68 
 
 		 739 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 775 aa  260  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 790 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 763 aa  256  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 743 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 749 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 758 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 758 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 736 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 758 aa  250  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 728 aa  250  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 723 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 794 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 745 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 758 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 750 aa  247  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 777 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 785 aa  245  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 759 aa  244  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 771 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 784 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 786 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 796 aa  240  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 730 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 780 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 732 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 769 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 771 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 720 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 804 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 766 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 779 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 776 aa  231  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 822 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 762 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 		 754 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.47 
 
 		 755 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 771 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 729 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 713 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 730 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 		 748 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 753 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 771 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 759 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 765 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 744 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 743 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 771 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 722 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 825 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 737 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 751 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 741 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 784 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 764 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 794 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 832 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 720 aa  212  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 761 aa  211  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  27.75 
 
 		 797 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 809 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 725 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 767 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 717 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 774 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 792 aa  207  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 724 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 817 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 738 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  28.59 
 
 		 807 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 732 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 810 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>