More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1708 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 808 aa  1638    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  65.72 
 
 		 814 aa  1027    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  47.96 
 
 		 855 aa  640    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  44.64 
 
 		 851 aa  628  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  43.25 
 
 		 848 aa  618  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  45.19 
 
 		 873 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  45.6 
 
 		 854 aa  606  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  44.88 
 
 		 878 aa  598  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 786 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 		 767 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 803 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 778 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 778 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 790 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 790 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 835 aa  379  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 771 aa  347  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 800 aa  344  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 800 aa  344  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 832 aa  332  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 815 aa  330  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 720 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 833 aa  277  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 903 aa  277  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 864 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 862 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 862 aa  260  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 838 aa  257  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 919 aa  253  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 815 aa  252  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 732 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 796 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 773 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 817 aa  238  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 710 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 741 aa  234  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 765 aa  234  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 761 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 756 aa  232  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 734 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 790 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 769 aa  231  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 784 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 734 aa  230  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.37 
 
 		 739 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 775 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 751 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 860 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 803 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 783 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 729 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 722 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 741 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 704 aa  226  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 790 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 880 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 755 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 777 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 747 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  34.9 
 
 		 896 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 749 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 794 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 726 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 757 aa  216  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 794 aa  216  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 775 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 763 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 733 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 771 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 773 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.93 
 
 		 839 aa  213  9e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 745 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 761 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 788 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 792 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 773 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 755 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 780 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 771 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 736 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 797 aa  207  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 780 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 743 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 764 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 761 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.94 
 
 		 715 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 767 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 769 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 728 aa  200  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.72 
 
 		 754 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 762 aa  201  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 786 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 784 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 776 aa  197  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 700 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 755 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  31.68 
 
 		 906 aa  196  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>