More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0905 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 748 aa  1528    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  45.42 
 
 		 720 aa  628  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  45.4 
 
 		 730 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 733 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 710 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 809 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 780 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 734 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 769 aa  240  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 730 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 		 754 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 785 aa  237  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 704 aa  235  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 761 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 803 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 763 aa  227  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 794 aa  224  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 762 aa  223  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 775 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 792 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 728 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 755 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 747 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 749 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 758 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 790 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 755 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 825 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 764 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 790 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 722 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 784 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 726 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 746 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 741 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 723 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 702 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 786 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 739 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 767 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 724 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 730 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 759 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 808 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 769 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 750 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 775 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 743 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 766 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 736 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 771 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 773 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 751 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 765 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 783 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 817 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 774 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 728 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 773 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 759 aa  188  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 767 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 796 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.76 
 
 		 755 aa  187  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 786 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 771 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 745 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.68 
 
 		 715 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 758 aa  184  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 713 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 729 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 792 aa  183  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 797 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 771 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 840 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 832 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 720 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 806 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.15 
 
 		 741 aa  180  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 733 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 744 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 787 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 771 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 758 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 756 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 743 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 713 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 758 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 758 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 777 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 767 aa  174  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 764 aa  173  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 776 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 795 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 743 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>