More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4140 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 733 aa  1500    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  39.14 
 
 		 720 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  38.87 
 
 		 730 aa  425  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  35.33 
 
 		 748 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.97 
 
 		 754 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 763 aa  267  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 749 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 809 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 785 aa  257  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 730 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 710 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 780 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 780 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 741 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 769 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.07 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 761 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 765 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 729 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 803 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 717 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 722 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 761 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 734 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 722 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 784 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 743 aa  230  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 704 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 720 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 790 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 726 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 825 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 736 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 759 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 758 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 804 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 779 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 755 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 747 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 758 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 758 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 750 aa  215  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 775 aa  214  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 790 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 774 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 745 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 766 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 762 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 728 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 758 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 786 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 784 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 767 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 726 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 776 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 732 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 695 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 792 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 773 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 817 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 771 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 786 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 771 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 764 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 773 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 777 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 769 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 733 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 773 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 741 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 787 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.64 
 
 		 755 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 730 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 796 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 770 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 744 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 843 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 807 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 780 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 794 aa  180  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 777 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 782 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 730 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 724 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 764 aa  177  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 732 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 779 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 779 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 851 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.45 
 
 		 715 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 758 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>