More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3084 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 730 aa  1478    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 784 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 784 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 804 aa  321  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 780 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 755 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 803 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 776 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 771 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 765 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 763 aa  288  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 790 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 787 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 743 aa  284  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 779 aa  283  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 761 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 704 aa  277  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 736 aa  274  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 741 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 710 aa  271  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 728 aa  269  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 817 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 783 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 799 aa  266  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  30.53 
 
 		 797 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 749 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 761 aa  263  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 720 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 780 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 775 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 		 759 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 730 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 734 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 765 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 722 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.37 
 
 		 739 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 745 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 792 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 729 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 775 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 747 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 766 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  28.37 
 
 		 807 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 764 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 750 aa  243  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 774 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 753 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 728 aa  240  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 723 aa  240  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 770 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 792 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 733 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 803 aa  235  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 858 aa  233  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  26.99 
 
 		 850 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 795 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 778 aa  230  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 732 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 763 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 759 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 755 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 788 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 747 aa  224  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.67 
 
 		 754 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 764 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 780 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 737 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 786 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 806 aa  220  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 758 aa  220  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 786 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28 
 
 		 741 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 735 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 778 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 771 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 743 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 761 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 722 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 771 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 767 aa  213  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 773 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 717 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 731 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 794 aa  209  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 744 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 777 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 800 aa  207  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 800 aa  207  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 759 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 853 aa  207  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 790 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 790 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 796 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>