More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3530 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 785 aa  1610    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 763 aa  320  7.999999999999999e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 730 aa  307  5.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 704 aa  296  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 743 aa  290  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 769 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 759 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 764 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 780 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 761 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 803 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 775 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 790 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 792 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 780 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 733 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 743 aa  265  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 761 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 737 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 784 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 765 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 726 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 804 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 809 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 790 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 754 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 771 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 779 aa  250  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 748 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 720 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 751 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 728 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 741 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 761 aa  245  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 732 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 728 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 832 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 745 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 755 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 769 aa  241  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 766 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 759 aa  239  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 734 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 784 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 758 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 774 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 758 aa  238  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 749 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 794 aa  235  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 783 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 758 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 724 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 722 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 796 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.94 
 
 		 739 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 789 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.36 
 
 		 755 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 796 aa  231  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 750 aa  231  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 779 aa  231  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  28.52 
 
 		 747 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 825 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 729 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 747 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 723 aa  227  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 710 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 807 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 776 aa  225  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 794 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 741 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 784 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 758 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 808 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 786 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 757 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 780 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 722 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 787 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 755 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 812 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 773 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 735 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 817 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 753 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 756 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.41 
 
 		 797 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 746 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 809 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 738 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 794 aa  209  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 730 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 857 aa  208  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>